Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf17Q53FE4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms