Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC184Q52MB2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms