Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms