Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TBRG1Q3YBR2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms