Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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GEN1Q17RS7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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GEN1Q17RS7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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