Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DDR2Q16832 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDR2Q16832 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
DDR2Q16832 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDR2Q16832 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DDR2Q16832 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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