Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms