Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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E2F4Q16254 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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