Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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