Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms