Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCM1Q15154 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms