Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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