Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 28.27□□□□□ -1.099e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 WDR26-208ENST00000486652 2867 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.175e-11■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 215.78■□□□□ 0.125e-11■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 514.72□□□□□ -0.055e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 514.29□□□□□ -0.125e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.255e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.285e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-11■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-21■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 56.7□□□□□ -1.345e-11■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-207ENST00000539204 649 ntTSL 313.99□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-216ENST00000544622 685 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-213ENST00000542641 669 ntTSL 411.16□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-218ENST00000546298 564 ntTSL 49.94□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-212ENST00000542002 952 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 YBX3-208ENST00000540447 6393 ntTSL 28.45□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 29.17□□□□□ -0.941e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.87□□□□□ -1.631e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 URI1-206ENST00000574110 2495 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.272e-10■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-10■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.432e-10■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.167e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SOD1-203ENST00000470944 1746 ntTSL 227.4■■□□□ 1.982e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SOD1-204ENST00000476106 586 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 HNRNPM-210ENST00000598367 298 ntTSL 512.04□□□□□ -0.484e-10■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TARS-213ENST00000513066 656 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TARS-207ENST00000505012 608 ntTSL 49.78□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TARS-214ENST00000514259 466 ntTSL 45.02□□□□□ -1.613e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TIMM44-205ENST00000597926 819 ntTSL 319.05■□□□□ 0.641e-9■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 524.43■■□□□ 1.54e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.384e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.34e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 EIF4A1-227ENST00000583217 599 ntTSL 210.52□□□□□ -0.737e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 420.27■□□□□ 0.842e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-217ENST00000559690 680 ntTSL 39.52□□□□□ -0.892e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 37.09□□□□□ -1.272e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 26.79□□□□□ -1.322e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-211ENST00000558923 625 ntTSL 35.8□□□□□ -1.482e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 MORF4L1-219ENST00000559751 639 ntTSL 55.67□□□□□ -1.52e-23■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.111e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GATA2-204ENST00000489987 1433 ntTSL 220.17■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 217.21■□□□□ 0.351e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 311.64□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 HNRNPL-214ENST00000601813 593 ntTSL 514.38□□□□□ -0.118e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 526.08■■□□□ 1.771e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 520.7■□□□□ 0.91e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 418.02■□□□□ 0.481e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 517.07■□□□□ 0.321e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 316■□□□□ 0.151e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 415.31■□□□□ 0.041e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 510.89□□□□□ -0.671e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 29.05□□□□□ -0.961e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -12e-10■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GOLGA2-204ENST00000461031 475 ntTSL 314.19□□□□□ -0.148e-14■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-19■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 312.97□□□□□ -0.331e-31■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 XRCC6-207ENST00000464116 359 ntTSL 28.76□□□□□ -1.012e-16■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ABCF1-207ENST00000542772 223 ntTSL 35.62□□□□□ -1.511e-31■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 NASP-214ENST00000527932 650 ntTSL 37.28□□□□□ -1.244e-21■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-211ENST00000598240 3235 ntTSL 213.82□□□□□ -0.24e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.914e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.635e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.615e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 INO80B-206ENST00000469849 689 ntTSL 531.38■■■□□ 2.615e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.095e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 321.46■■□□□ 1.035e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 318.61■□□□□ 0.575e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 517.99■□□□□ 0.475e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 217.59■□□□□ 0.415e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ABCA7-217ENST00000533574 587 ntTSL 417.48■□□□□ 0.395e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.345e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 INO80B-WBP1-201ENST00000441673 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.16■□□□□ 0.025e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.085e-8■□□□□ 9.4
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 278.6 ms