Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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UBE4AQ14139 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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