Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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