Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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