Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FHL3Q13643 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms