Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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