Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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