Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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