Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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