Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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