Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms