Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP140Q13342 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP140Q13342 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SP140Q13342 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms