Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATMQ13315 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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