Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SKP2Q13309 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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