Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms