Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms