Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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