Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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