Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms