Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBRQ0VD83 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms