Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms