Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC1Q08554 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms