Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms