Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDR1Q08345 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms