Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms