Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms