Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms