Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RHDQ02161 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RHDQ02161 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RHDQ02161 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RHDQ02161 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RHDQ02161 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RHDQ02161 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHDQ02161 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHDQ02161 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHDQ02161 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms