Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms