Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B2Q01814 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B2Q01814 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms