Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms