Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms