Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK3Q00526 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms