Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL7P80098 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL7P80098 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL7P80098 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms