Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEF1A1P68104 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms