Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPNP63162 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms