Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBA52P62987 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBA52P62987 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBA52P62987 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms