Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A1P60842 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms